新技術提高了冷凍電子顯微鏡的清晰度和安全性
紐約州伊薩卡市——當科學家需要可視化用來浸潤人體細胞的刺突蛋白的結構時,他們轉向了冷凍電子顯微鏡。作為研究人員武器庫中最強大的成像工具之一,冷凍電子顯微鏡 (cryo-EM) 可以將蛋白質、病原體和各種細胞成分可視化,幾乎可以看到它們的單個原子。
但是為冷凍電鏡準備樣品是一個繁瑣的過程,它依賴于乙烷——一種強大的液態(tài)冷卻劑,在室溫下是一種容易爆炸的易燃氣體。
9 月 7 日發(fā)表在國際晶體學聯(lián)盟雜志上的一項新研究表明,可以使用更安全、更便宜的冷卻劑——液氮——制備冷凍電鏡樣品,這些樣品可以產生比用乙烷制備的樣品更清晰的圖像。這些發(fā)現(xiàn)顛覆了可追溯到 1980 年代的傳統(tǒng)智慧,并可能提高冷凍電鏡的安全性和質量。
“乙烷不是標準的實驗室化學品。這是危險的,并利用它增加了額外的復雜,”資深作者羅伯特·索恩,在藝術和科學學院和韋斯研究員物理學教授。“液氮是首選的冷卻劑。”
Cryo-EM 的工作原理是通過在玻璃狀水中閃凍的分子發(fā)射電子,捕捉冰中分子的多個模糊圖像。復雜的軟件通??梢詫⑦@些模糊的剪輯平均化為一張清晰的 3D 圖像,但并非始終如一。
一些模糊來自樣本本身。當包裹分子的水冷卻得太慢時,它會形成冰晶,從而降低圖像質量??茖W家們通過使用乙烷快速冷卻水以使其卡入玻璃狀、無晶體的薄片來規(guī)避這個問題。但是如此快速的冷凍會給位于金薄膜上的紙張帶來壓力。當電子束撞擊紙張時,應力會導致分子移動,從而以一種稱為電子束誘導運動的現(xiàn)象來模糊最終圖像。
“我們有兩個相反的因素,”索恩說。“我們希望快速冷卻樣品,以防止冰晶形成并捕獲分子的生物結構。但我們也希望盡可能緩慢地冷卻樣品,以盡量減少它們在成像過程中的運動。”
乙烷可以非常快速地冷卻樣品。但研究人員必須使用液氮將乙烷氣體轉化為液體,然后在冷凍后更多的液氮來儲存樣品。“乙烷很麻煩,很危險,最終,無論如何,樣品最終都會在液氮中,”索恩說。
根據(jù)過去 40 年的報告,液氮的冷卻速度大約比乙烷慢 50 倍,這還不足以將水轉化為玻璃狀薄片。但是在 2006 年,Thorne 的研究小組發(fā)現(xiàn)使氮氣減速的主要因素是在液體表面上方盤旋的冷氣體,它在小樣品到達液體之前冷卻了它們。
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