人體組織由排列成復(fù)雜結(jié)構(gòu)的不同細(xì)胞類(lèi)型組成，這些細(xì)胞在單個(gè)細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞之間發(fā)送蛋白質(zhì)信號(hào)。在標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)量中，這些細(xì)胞結(jié)構(gòu)混合在一起，將信號(hào)網(wǎng)絡(luò)混合在一起。
太平洋西北國(guó)家實(shí)驗(yàn)室 (PNNL) 的科學(xué)家使用染色的人類(lèi)胰腺樣本來(lái)實(shí)現(xiàn)胰腺胰島(產(chǎn)生胰島素的微器官)區(qū)域的可視化，并展示如何使用 microPOTS 蛋白質(zhì)組技術(shù)來(lái)表征區(qū)域特異性蛋白質(zhì)信號(hào)。
這種方法揭示了人類(lèi)胰腺樣本中的胰島素信號(hào)蛋白位于胰島細(xì)胞周?chē)皇歉h(yuǎn)的地方。他們的研究發(fā)表在《分子與細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)》上上。
目前，大多數(shù)源自基因、轉(zhuǎn)錄本、蛋白質(zhì)或代謝物的組學(xué)測(cè)量均來(lái)自大塊組織。然而，當(dāng)科學(xué)家測(cè)量整個(gè)組織片段時(shí)，經(jīng)常會(huì)錯(cuò)過(guò)生物樣本中發(fā)生的微觀變化。
該研究展示了如何將標(biāo)準(zhǔn)分析流程用于空間蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)量，使研究人員能夠識(shí)別整個(gè)組織中無(wú)法在大塊組織水平上測(cè)量的趨勢(shì)。通過(guò)應(yīng)用這些計(jì)算工具應(yīng)用于 microPOTS 數(shù)據(jù)，可以識(shí)別組織特定區(qū)域內(nèi)發(fā)生變化的生物信號(hào)傳導(dǎo)途徑。這一發(fā)現(xiàn)證明這些計(jì)算方法可用于解釋額外的空間蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)量并識(shí)別新的生物學(xué)。
現(xiàn)有技術(shù)目前無(wú)法滿足對(duì)臨床上可用的方法來(lái)匹配異質(zhì)組織內(nèi)蛋白質(zhì)活性的需求。 MicroPOTS可用于測(cè)量相對(duì)蛋白微米級(jí)樣品中的豐度以及每次測(cè)量的空間位置，從而將生物學(xué)上感興趣的蛋白質(zhì)和通路與不同區(qū)域聯(lián)系起來(lái)。然而，考慮到測(cè)量的像素/體素?cái)?shù)量和數(shù)量較小，標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜分析流程已被證明是不夠的。
標(biāo)簽：
免責(zé)聲明：本文由用戶(hù)上傳，如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系刪除！