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SARS-CoV-2基因組分析揭示了新的墨西哥變種

導讀 博洛尼亞大學藥學與生物技術(shù)系的一個研究小組分析了超過一百萬個 SARS-CoV-2 基因組序列。這種分析導致確定了一種新變種,該變種在過去幾

博洛尼亞大學藥學與生物技術(shù)系的一個研究小組分析了超過一百萬個 SARS-CoV-2 基因組序列。這種分析導致確定了一種新變種,該變種在過去幾周主要在墨西哥傳播,但也在歐洲發(fā)現(xiàn)。他們發(fā)表在《醫(yī)學病毒學雜志》上的論文提出了所謂的“墨西哥變種”,其學名是 T478K。與其他菌株一樣,這會導致Spike 蛋白發(fā)生突變,從而使能夠附著并穿透其靶細胞。

這種變體越來越多地在北美人群中傳播,尤其是在墨西哥。迄今為止,該變種覆蓋了該領(lǐng)域現(xiàn)有病毒的 50% 以上。傳播的速度和速度讓人想起“英國變體”。Spike 蛋白的突變在結(jié)構(gòu)上位于與人類受體 ACE2 相互作用的區(qū)域。附著在該受體上以感染細胞,從而以更有效的方式傳播感染”。

Federico Giorgi,博洛尼亞大學藥學與生物技術(shù)系研究協(xié)調(diào)員兼教授

研究人員從分析在國際數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn)的近 120 萬份 SARS-CoV-2 基因組測序樣本開始,直到 2021 年 4 月 27 日。在 11435 個樣本中檢測到了新的 T478K 變體。這是一個月前呈現(xiàn)相同變體的樣本數(shù)量的兩倍。自 2021 年初以來的這種增長使研究人員感到震驚。“墨西哥變種”在男性和女性以及年齡范圍內(nèi)均勻分布。這種變異占墨西哥所有測序的 52.8%,而在美國它僅出現(xiàn)在 2.7% 的測序樣本中。至于歐洲,“墨西哥變種”在德國、瑞典和瑞士的傳播很弱。在幾乎不存在,只有 4 例報告病例。

表征該變體的突變位于負責與人類受體 ACE2 相互作用的 Spike 蛋白區(qū)域:這是允許進入細胞的機制。類似的突變對于過去幾個月引起關(guān)注的所有變體都很常見。事實上,最近的變種因其高感染率而引人注目,這使得它們在世界許多地區(qū)普遍存在。

研究人員通過計算機模擬測試了 T478K Spike 蛋白的作用,發(fā)現(xiàn)這種突變蛋白可以改變表面靜電荷。因此,它不僅可以改變與 ACE2 人蛋白的相互作用,還可以改變與免疫系統(tǒng)抗體的相互作用,從而阻礙藥物療效。

Giorgi 總結(jié)道:“由于國際數(shù)據(jù)庫中有大量可用數(shù)據(jù),我們可以通過監(jiān)測變種在不同地理區(qū)域的傳播,幾乎實時控制局勢。”“在接下來的幾個月里繼續(xù)努力對于迅速采取有效手段至關(guān)重要”。

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