弗吉尼亞大學醫(yī)學院的科學家們開發(fā)了重要的新資源，這些資源將有助于抗擊癌癥并推進前沿的基因組學研究。
UVA的Chongzhi Zang博士及其同事和學生們開發(fā)了一種新的計算方法，可以根據(jù)實驗數(shù)據(jù)在三個維度上繪制染色體的折疊模式。這很重要，因為染色體內(nèi)部遺傳物質(zhì)的配置實際上會影響我們基因的工作方式。在癌癥中，這種配置可能會出錯，因此科學家們希望了解健康細胞和癌細胞的基因組結構。除了推進醫(yī)學研究的許多其他領域之外，這將幫助他們開發(fā)更好的方法來治療和預防癌癥。
Zang及其同事和學生已經(jīng)使用他們的新方法發(fā)掘了有用數(shù)據(jù)的寶庫，并且正在將其技術和發(fā)現(xiàn)提供給他們的同行科學家。為了推進癌癥研究，他們甚至建立了一個交互式網(wǎng)站，將他們的發(fā)現(xiàn)與來自其他資源的大量數(shù)據(jù)結合在一起。他們說，他們的新網(wǎng)站bartcancer.org可以為癌癥研究人員提供“獨特見解”。
UVA公共衛(wèi)生中心的計算生物學家Zang說：“基因組的折疊模式具有很高的動態(tài)性;它的變化頻繁，并且在細胞之間也有所不同。我們的新方法旨在將這種動態(tài)模式與基因活性的控制聯(lián)系起來。”基因組學和UVA癌癥中心。“更好地了解這一聯(lián)系可以幫助闡明癌癥和其他疾病的遺傳原因，并可以指導精密醫(yī)學的未來藥物開發(fā)。”
在BART上下注
Zang繪制基因組折疊圖的新方法稱為BART3D。從本質(zhì)上講，它會將有關一個染色體區(qū)域的可用三維結構數(shù)據(jù)與許多鄰近區(qū)域進行比較。然后，可以使用這種比較方法推斷出這些結果，使用他們最近開發(fā)的一種新穎算法“結合轉錄調(diào)控的結合分析”或BART來填補遺傳物質(zhì)藍圖中的空白。結果是一張圖譜，為我們的基因如何與控制其活性的“轉錄調(diào)節(jié)因子”相互作用提供了前所未有的見識。識別這些調(diào)節(jié)劑有助于科學家了解打開和關閉特定基因的原因-它們可用于抗擊癌癥和其他疾病的信息。
標簽： 抗癌
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