根據(jù)國際研究聯(lián)盟的一項新研究，每個城市都有自己獨特的微生物組，即獨特識別病毒和細菌的“指紋”，該研究組包括馬里蘭大學醫(yī)學院(UMSOM)的一個團隊。這個國際項目對從全球60個城市的公共交通系統(tǒng)和醫(yī)院收集的樣本進行了測序和分析，今天發(fā)表在《細胞》雜志上。
該研究被認為是有史以來全球最大的城市微生物群宏研究，涵蓋多個城市的空氣和地表。它具有對所有鑒定出的微生物種類的全面分析-包括數(shù)千種病毒和細菌以及參考數(shù)據(jù)庫中找不到的兩種新近鑒定出的單細胞生物。
研究合著者Lynn Schriml，博士，UMSOM基因組科學研究所(IGS)流行病學與公共衛(wèi)生學系副教授，領導了巴爾的摩過境系統(tǒng)的研究抽樣工作。她說：“巴爾的摩獨特的微生物特征揭示了一個獨特的，令人著迷的，多樣化的世界，提供了對地理變異和以前未知的微生物基因組的見解。”
研究高級作者克里斯托弗·梅森(Christopher Mason)博士，威爾康奈爾大學(Will Cornell Medicine)教授，世界定量預測倡議組織(WorldQuant Initiative for Quantitative Prediction)的負責人補充道：“每個城市都有定義其微生物的'分子回聲'。如果您給我穿上鞋子，我可以以大約90%的準確率告訴您您所來自的世界城市。”
該研究是在大流行關閉世界各地的城市之前進行的，因此研究人員現(xiàn)在正在研究大流行如何影響每個城市的微生物組指紋。施里默說：“這是一個很好的問題，我們將在后續(xù)研究中解決這個問題。”該聯(lián)盟于2020年啟動了MetaCOV項目，以調查城市元基因組的變化，并分離出SARS-CoV-2病毒(引起的病毒)在城市環(huán)境(例如ATM機，廢水，醫(yī)院，公交系統(tǒng))中的存在)。
最新研究的結果是基于對過去三年來對六大洲城市的4,728個樣本進行的分析得出的，這些樣本代表了全球第一個系統(tǒng)的城市微生物生態(tài)系統(tǒng)目錄。除了在各個城市中具有明顯的微生物特征外，分析還揭示了一組核心的31種物種，這些物種在整個采樣城市地區(qū)的97%的采樣中都被發(fā)現(xiàn)。研究人員確定了4,246種已知的城市微生物，但他們還發(fā)現(xiàn)，任何后續(xù)采樣仍可能會繼續(xù)發(fā)現(xiàn)以前從未見過的物種，這凸顯了與等待城市環(huán)境中的微生物多樣性和生物功能有關的發(fā)現(xiàn)的潛在潛力。 。
將來，該發(fā)現(xiàn)還具有許多潛在的實際應用，包括確定可用作抗生素的潛在新化合物以及由生物合成基因簇(BGC)注釋的具有開發(fā)藥物前景的小分子。
標簽： 細菌微生物
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