得益于折紙方法RNA納米結構可能會改善很多
“納米衛(wèi)星探索折疊空間”。CodyGeary的藝術家渲染展示了一顆RNA衛(wèi)星,探索折疊的可能性以及在納米醫(yī)學和合成生物學中的應用。
RNA的單鏈性質使其能夠通過折疊形成復雜的結構。利用RNA納米技術,開發(fā)了一種單鏈結構(稱為RNA折紙),專注于設計用于醫(yī)學和合成生物學應用的自組裝RNA納米結構。該過程通過類似折紙的核酸折疊形成納米結構。
現在,在一項新的研究中,研究人員揭示了RNA折疊的規(guī)則和機制,這將使構建更理想和功能性的RNA顆粒用于基于RNA的醫(yī)學成為可能。
作者指出,RNA折紙等方法已被用于“設計結構RNA支架,以傳遞siRNA以在細胞中進行基因敲除,結合凝血酶以起到抗凝劑的作用,在體內表達和折疊,并作為蛋白質支架調節(jié)基因表達。”他們表示,當前的研究為改進RNA納米器件的設計周期提供了結構基礎。
這項工作發(fā)表在《自然·納米技術》雜志上的論文《共轉錄RNA折紙的結構、折疊和靈活性》中。”
該論文描述了如何使用RNA折紙技術來設計通過冷凍電子顯微鏡(cryo-EM)表征的RNA納米結構。冷凍電鏡研究為RNA折紙的詳細結構提供了寶貴的見解,從而可以優(yōu)化設計過程并產生更理想的形狀。
丹麥奧胡斯大學跨學科納米科學中心(iNANO)副教授EbbeSlothAndersen博士解釋道:“借助冷凍電鏡的精確反饋,我們現在有機會微調分子設計并構建日益復雜的納米結構。”。
奧爾胡斯大學化學系和iNANO教授JanSkovPedersen博士指出:“發(fā)現一種RNA分子的重折疊速度如此之慢,真是令人驚訝,因為折疊通常發(fā)生在不到一秒的時間內。”
“我們希望能夠利用類似的機制在正確的時間和地點激活患者體內的RNA療法,”EwanMcRae博士解釋道,他正在休斯敦衛(wèi)理公會研究所的RNA治療中心組建自己的研究小組在德克薩斯州。
為了演示復雜形狀的形成,研究人員受哈勃太空望遠鏡的啟發(fā),將RNA矩形和圓柱體組合起來,創(chuàng)建了一個多域“納米衛(wèi)星”形狀。
奧爾胡斯大學助理教授CodyGeary博士表示:“我設計的納米衛(wèi)星是RNA設計如何讓我們探索折疊空間(折疊的可能性空間)和細胞內空間的象征,因為納米衛(wèi)星可以在細胞中表達。”iNANO,最初開發(fā)了RNA折紙方法。
然而,事實證明,由于衛(wèi)星的柔性特性,很難用冷凍電鏡來表征,因此樣本被送往美國的一個實驗室,在那里他們專門通過電子斷層掃描(IPET方法)確定單個粒子的3D結構。
“RNA衛(wèi)星是一個巨大的挑戰(zhàn)!但通過使用我們的IPET方法,我們能夠表征單個粒子的3D形狀,從而確定納米衛(wèi)星上動態(tài)太陽能電池板的位置。”加利福尼亞州勞倫斯伯克利國家實驗室的分子鑄造廠。
RNA折紙的研究有助于改進用于醫(yī)學和合成生物學的RNA分子的合理設計。由諾和諾德基金會支持的新的跨學科聯盟COFOLD將繼續(xù)研究RNA折疊過程。
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