單細胞 RNA 測序分析揭示五種自身免疫性疾病的免疫細胞異質性

自身免疫性疾病是由于免疫異常攻擊健康細胞、組織或器官而引起的一組疾病。單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術提供單細胞分辨率的轉錄組信息，從而為研究自身免疫性疾病提供了一種新方法。然而，大多數(shù)單細胞 RNA 測序研究通常集中于一種類型的自身免疫性疾病。

這項研究發(fā)表在BIO Integration上，整合了五種不同自身免疫性疾病(IgA 腎病 [IgAN]、川崎病 [KD]、多發(fā)性硬化癥 [MS]、干燥綜合征 [SS] 和系統(tǒng)性紅斑狼瘡[SLE])。對這些數(shù)據(jù)中的所有免疫細胞進行了維度聚類、細胞通訊分析、單核細胞、NK 細胞群的重新聚類分析、差異基因表達分析和功能富集。

整合了五種不同自身免疫性疾病(IgAN、KD、MS、SS 和 SLE)外周血細胞的 scRNA-seq 結果。盡管五種疾病的細胞簇群不同，但所有樣本均包含 18 種不同的免疫細胞亞群。

通過細胞間通訊網(wǎng)絡分析，研究人員確定 IgAN 和 SLE 患者的經(jīng)典和非經(jīng)典單核細胞信號顯著增強。KD 患者的初始 B 細胞信號增強。有趣的是，NK 和 NK-T 細胞的信號在 SS 患者中增強，但在 IgAN 和 SLE 患者中減弱。

對經(jīng)典和非經(jīng)典單核細胞亞群的轉錄組分析進一步揭示，促炎細胞因子和干擾素相關基因，包括 CCL3、IL1B、ISG15 和 IFI6，在 IgAN 和 SLE 患者中特異性增加。與單核細胞不同，IgAN 和 KD 患者的數(shù)量和 NK 標記基因減少，但 SS 患者的數(shù)量和 NK 標記基因增加。同時，在 SS 中專門發(fā)現(xiàn)了兩種 NK-T 細胞亞群。

綜上所述，基于單細胞RNA-seq結果的整合，該團隊證明了五種不同自身免疫性疾病的免疫細胞景觀在免疫細胞亞群、群體、差異表達基因以及細胞與細胞之間的關系等方面的變化。 -蜂窩通信網(wǎng)絡。這些數(shù)據(jù)為進一步探索不同自身免疫性疾病之間的異質性和相似性提供了新的見解。

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