全面的蛋白質組數(shù)據(jù)集可幫助癌癥研究人員解開分子之謎
美國國立衛(wèi)生研究院正在發(fā)布一個全面的數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集對來自 10 種癌癥類型的 1,000 多個腫瘤的單獨研究的基因組、蛋白質組、成像和臨床數(shù)據(jù)進行了標準化。來自世界各地的研究人員將能夠利用這一公開資源來揭示有關癌癥如何發(fā)展和進展的新分子見解。該數(shù)據(jù)集由美國國立衛(wèi)生研究院下屬國家癌癥研究所的臨床蛋白質組學腫瘤分析聯(lián)盟 (CPTAC) 生成。
《Cancer Cell》發(fā)表的一篇論文描述了泛癌蛋白質組數(shù)據(jù)集,它建立在蛋白質組科學數(shù)十年的技術進步的基礎上。該數(shù)據(jù)集的推出支持-哈里斯政府的“癌癥登月”目標,即通過改進數(shù)據(jù)共享加速癌癥研究。
CPTAC 研究人員在《 Cell》上發(fā)表的另外兩篇研究論文初步證明了該數(shù)據(jù)集作為科學發(fā)現(xiàn)的寶貴資源的潛力。在第一篇論文中,多組學分析用于將癌癥驅動突變與蛋白質模式聯(lián)系起來。第二篇論文深入研究了調節(jié)細胞信號傳導和生理學的蛋白質修飾,以顯示不同腫瘤類型與 DNA 修復、代謝和免疫的關聯(lián)。
泛癌癥蛋白質基因組數(shù)據(jù)集將通過 NCI 癌癥研究數(shù)據(jù)共享存儲庫公開提供。蛋白質組學數(shù)據(jù)可以通過蛋白質組學數(shù)據(jù)共享訪問?;蚪M和轉錄組數(shù)據(jù)可以通過基因組數(shù)據(jù)共享和癌癥數(shù)據(jù)服務訪問。
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