使用蛋白質(zhì)組和小 RNA 數(shù)據(jù)預(yù)測人血漿年齡：比較分析

一篇題為“使用蛋白質(zhì)組學(xué)和小RNA數(shù)據(jù)進(jìn)行人類血漿年齡預(yù)測：比較分析”的新研究論文已發(fā)表在《Aging》雜志上。

基于綜合分子數(shù)據(jù)構(gòu)建的衰老時(shí)鐘已成為醫(yī)學(xué)、法醫(yī)學(xué)和生態(tài)研究領(lǐng)域有前景的工具。然而，很少有研究比較不同分子數(shù)據(jù)類型預(yù)測同一隊(duì)列中年齡的適用性，以及將它們結(jié)合起來是否會改善預(yù)測。在這項(xiàng)新研究中，加文新南威爾士大學(xué)卡羅林斯卡學(xué)院的研究人員 Jérôme Salignon、Omid R. Faridani、Tasso Miliotis、Georges E. Janssens、Ping Chen、Bader Zarrouki、Rickard Sandberg、Pia Davidsson 和 Christian G. Riedel醫(yī)學(xué)研究所和阿斯利康在 103 份人類血漿樣本中的蛋白質(zhì)和小 RNA 水平上對此進(jìn)行了探索。

研究小組寫道：“在這里，我們擴(kuò)大了根據(jù)同一隊(duì)列的不同類型分子數(shù)據(jù)構(gòu)建的衰老時(shí)鐘之間有限的比較組合。”

首先，研究人員使用兩步質(zhì)譜法測量 612 種蛋白質(zhì)，選擇并量化豐度隨年齡變化的 21 種蛋白質(zhì)。值得注意的是，隨著年齡的增長，補(bǔ)體系統(tǒng)成分的蛋白質(zhì)含量也隨之增加。接下來，他們使用小 RNA 測序來選擇和量化一組 315 個(gè)小 RNA，這些小 RNA 的豐度隨著年齡的增長而變化。其中大部分是微小RNA (miRNA)，隨著年齡的增長而下調(diào)，并預(yù)測其目標(biāo)基因與生長、癌癥和衰老相關(guān)。最后，該團(tuán)隊(duì)利用收集到的數(shù)據(jù)建立了年齡預(yù)測模型。

在不同類型的分子中，蛋白質(zhì)產(chǎn)生的模型最準(zhǔn)確(R² = 0.59 ± 0.02)，其次是 miRNA，是表現(xiàn)最好的小 RNA 類別(R² = 0.54 ± 0.02)。有趣的是，蛋白質(zhì)和 miRNA 數(shù)據(jù)的結(jié)合使用改善了預(yù)測 (R² = 0.70 ± 0.01)。未來的工作將需要使用更大的樣本量和驗(yàn)證數(shù)據(jù)集來確認(rèn)這些結(jié)果。

研究人員總結(jié)道：“盡管如此，我們的研究表明，結(jié)合蛋白質(zhì)組和 miRNA 數(shù)據(jù)可以產(chǎn)生更好的年齡預(yù)測，這可能是通過捕獲更廣泛的與年齡相關(guān)的生理變化來實(shí)現(xiàn)的。確定結(jié)合不同分子數(shù)據(jù)類型是否可以作為一種通用的方法將很有趣。”改善未來老化時(shí)鐘的策略。”

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