牛津大學領導的一項合作研究是英國 100,000 基因組計劃的一部分，今天發(fā)表在《自然遺傳學》上，該研究定義了最常見的血癌類型慢性淋巴細胞白血病 (CLL) 的五個新亞群，并將這些亞群與臨床結果相關聯(lián).這種對患者進行風險分層的新方法可能會帶來更加個性化的患者護理。
這是第一項分析整個癌癥基因組而非靶向區(qū)域的所有相關 DNA 變化的研究，以對癌癥患者進行分類并將這些亞組與臨床結果聯(lián)系起來。
領導這項研究的牛津大學腫瘤學系 Anna Schuh 教授說：“我們知道，癌癥基本上是一種由個體一生中獲得的 DNA 變化引起的疾病。我們目前使用的實驗室工具預測患者是否可能對給定療法產(chǎn)生反應通常只關注癌癥 DNA 中的單一異常，并不能準確預測患者的臨床結果。這就是為什么我們問了一個簡單的問題：我們能否提高當前檢測的精度通過一次查看癌癥中所有獲得的 DNA 變化?”
這項研究分析了485 名 CLL 患者的全基因組序列，這些患者參加了由利物浦大學和利茲大學領導的國家臨床試驗，為利物浦的英國 CLL 生物庫提供樣本，并同意將他們的樣本用于 100,000 基因組計劃由 Genomics England 運營。
通過比較這些患者的癌癥和健康組織的全基因組測序數(shù)據(jù)，該團隊能夠繪制已知和新發(fā)現(xiàn)的 DNA 變化、結構改變、癌癥突變特征以及與整個基因組中的 CLL 相關的其他全局測量。他們確定了 186 種不同且反復出現(xiàn)的基因組改變，并使用這些改變定義了與不同臨床結果相關的五個 CLL 基因組亞組。
在接受比本研究中包括的治療范圍更廣的治療(特別是靶向治療)的患者中進行額外驗證后，這些新的 CLL 基因組亞組可用于更好地指導治療選擇，以改善患者預后。
這項研究為全基因組分析在其他癌癥類型中進行風險分層的常規(guī)臨床應用鋪平了道路。
該團隊的分析還確定了 148 個新的假定 CLL 遺傳驅動因素。未來對這些驅動因素的研究可能會揭示 CLL 起始和進展的新機制，并具有開發(fā)新療法的潛力。
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