研究人員解決了人類轉錄因子調控問題
赫爾辛基大學的一個研究小組介紹了一項關于人類轉錄因子的新的大規(guī)模研究,該研究結合了兩種最先進的相互作用組學方法,可以快速識別蛋白質-蛋白質相互作用和這一重要基因家族的廣泛功能信息。
轉錄因子 (TFs) 是細胞發(fā)育、分化和維持體內平衡最重要的蛋白質組。它們在所有發(fā)育階段的細胞中驅動復雜的基因表達模式。TF 信號傳導的缺陷通常會導致發(fā)育障礙和疾病。
然而,雖然 TF DNA 結合已被廣泛研究,但我們仍然缺乏對 TF 活性和信號傳導如何通過與多種蛋白質(例如輔因子、二聚化伙伴、染色質調節(jié)蛋白、酶、抑制蛋白)相互作用來控制的系統(tǒng)級理解和一般轉錄因子。
赫爾辛基大學的一個研究小組決定啟動一項大型研究,以闡明 TF 蛋白-蛋白質相互作用和 TF 調控。這項新研究發(fā)表在《自然通訊》上。
“我們對 100 多個 TF 進行了全面的相互作用組分析,揭示了 7,000 多個 TF 蛋白質-蛋白質相互作用,其中大部分在核中并在轉錄調控中發(fā)揮重要作用,”HiLIFE 生物技術研究所的研究主任 Markku Varjosalo 說。
研究結果為進一步研究 TF 監(jiān)管鋪平了道路
本研究中發(fā)現的大量 TF 相互作用使研究人員能夠進行系統(tǒng)級分析,揭示具有特定生物學功能的 TF 組,例如染色質重塑和 RNA 剪接。
“有趣的是,幾乎一半的研究 TF 與 TF 的核因子家族相互作用。已知核因子在發(fā)育過程中控制過多的基因和器官發(fā)生,它們的異?;顒优c幾種人類癌癥類型有關。我們的數據表明轉錄控制NFI 可能受到核因子與其他 TF 相互作用的調節(jié),”該研究的主要作者 Helka Göös 博士說。
該研究首次對人類轉錄因子的物理和功能相互作用進行了全面而互補的概述。新發(fā)現為進一步研究 TF 監(jiān)管鋪平了道路。
“在過去的 10 年里,我們的實驗室一直在積極參與識別和研究癌癥和免疫缺陷中個體轉錄因子突變的疾病機制。TFs 已被證明是困難的藥物靶標,但它們的幾個關鍵調節(jié)劑更有希望。我們生成的關于 TF 的大量信息圖譜可以作為藥物發(fā)現研究的豐富資源,以確定 TF 相關疾病的藥物治療,”Varjosalo 博士說。
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