全球范圍內(nèi)繪制地球上所有植物、動(dòng)物、真菌和其他微生物生命基因組的努力正進(jìn)入一個(gè)新階段，從試點(diǎn)項(xiàng)目轉(zhuǎn)向全面生產(chǎn)測(cè)序。地球生物基因組計(jì)劃 (EBP) 的這一新階段以本周(1 月 17 日)在美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊上發(fā)表的一系列論文為標(biāo)志，描述了該項(xiàng)目的目標(biāo)、迄今為止的成就和下一步。
EBP 工作組主席、加州大學(xué)戴維斯分校進(jìn)化與生態(tài)學(xué)特聘教授哈里斯·萊溫 (Harris Lewin) 說(shuō)：“EBP 的特殊功能捕捉到了生物學(xué)史上最大規(guī)模的協(xié)同努力的精髓和激動(dòng)人心。” .“從基礎(chǔ)科學(xué)到突破性應(yīng)用，解決了一系列緊迫的全球問(wèn)題，例如防止生物多樣性喪失和使糧食作物適應(yīng)氣候變化，EBP 在真核生物測(cè)序方面取得的進(jìn)展令人謙卑和鼓舞人心。實(shí)現(xiàn)對(duì)所有真核生物進(jìn)行測(cè)序的最終目標(biāo)現(xiàn)在似乎觸手可及。”
EBP 于 2018 年 11 月啟動(dòng)，其目標(biāo)是提供所有 180 萬(wàn)種已命名的植物、動(dòng)物和真菌以及單細(xì)胞真核生物的完整 DNA 序列目錄。
如果不采取行動(dòng)遏制氣候變化和保護(hù)全球生態(tài)系統(tǒng)的健康，預(yù)計(jì)到本世紀(jì)末地球?qū)⑹?50% 的生物多樣性。為所有已知的真核生物創(chuàng)建一個(gè) DNA 序列數(shù)字圖書館，有助于為防止生物多樣性喪失和病原體傳播、監(jiān)測(cè)和保護(hù)生態(tài)系統(tǒng)以及增強(qiáng)生態(tài)系統(tǒng)服務(wù)提供有效工具。
網(wǎng)絡(luò)網(wǎng)絡(luò)
該項(xiàng)目作為一個(gè)國(guó)際網(wǎng)絡(luò)網(wǎng)絡(luò)，協(xié)調(diào)眾多特定群體、區(qū)域和國(guó)家規(guī)模的努力，例如加利福尼亞保護(hù)基因組計(jì)劃(美國(guó))、達(dá)爾文生命之樹計(jì)劃(英國(guó)和愛爾蘭)、脊椎動(dòng)物基因組計(jì)劃和 10,000 只鳥類基因組計(jì)劃。
該項(xiàng)目的行政辦公室位于加州大學(xué)戴維斯分?；蚪M中心。該中心也是加州保護(hù)基因組學(xué)項(xiàng)目的主要 DNA 測(cè)序中心，該項(xiàng)目由加州大學(xué)洛杉磯分校的 Bradley Shaffer 教授領(lǐng)導(dǎo)，旨在幫助加州利用基因組工具管理瀕危和經(jīng)濟(jì)上重要的物種。
第一階段目標(biāo)
EBP 的前兩年，即 2018-20 年，代表了啟動(dòng)階段。到 2023 年，第一階段的目標(biāo)是產(chǎn)生代表約 9,400 個(gè)分類科的參考基因組。到目前為止，附屬項(xiàng)目已經(jīng)產(chǎn)生了大約200個(gè)這樣的參考基因組，預(yù)計(jì)到2022年底完成測(cè)序、組裝和注釋3000多個(gè)，約占一期目標(biāo)的三分之一。
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