尋找癌癥基因的共享網(wǎng)絡

威爾莫特癌癥研究所的研究人員離了解導致細胞惡性的復雜基因相互作用又近了一步。在今天發(fā)表的一項新的Cell Reports研究中，該小組使用網(wǎng)絡建模來研究一組對惡性腫瘤至關(guān)重要的相互作用，并且可能成為廣泛癌癥治療的沃土。

可以被藥物靶向的離散基因突變僅在一小部分癌癥類型中被發(fā)現(xiàn)。但是這些突變依賴于非突變基因的下游網(wǎng)絡才能導致癌癥。這些下游基因及其錯綜復雜的相互作用可能在許多癌癥中很常見，并且可以為癌癥治療帶來巨大的飛躍。

該研究的主要作者之一，Hartmut “Hucky” Land 博士，他是威爾莫特癌癥研究所副所長，羅切斯特大學醫(yī)學中心生物醫(yī)學遺傳學羅伯特和多蘿西馬克教授，并曾在確定癌癥的共同核心特征超過 10 年。他的目標是找到癌癥的共同弱點并加以利用。

“靶向使細胞癌變必不可少的非突變蛋白質(zhì)是一種更廣泛的方法，可用于多種癌癥，”蘭德說，“但很難找到這些非突變的必需基因。”

這就是 Land 求助于威爾莫特癌癥研究所研究員、URMC 生物統(tǒng)計學和計算生物學副教授 Matthew McCall 博士、MHS 的原因。該研究的另一位主要作者麥考爾開發(fā)了一種新的網(wǎng)絡建模方法，稱為 TopNet，該小組將其與細胞和小鼠的基因?qū)嶒炁鋵?，以確定功能相關(guān)的基因網(wǎng)絡。

蘭德的小組之前確定了一組非常多樣化的非突變基因，這些基因?qū)Π┌Y至關(guān)重要。在這項研究中，該小組想看看這些基因是如何相互作用的——從 20 個基因的子集開始。在培養(yǎng)的細胞中增加或減少一種基因的表達會對組中其他基因的表達水平產(chǎn)生多種影響。

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