Weill Cornell Medicine 的研究人員在一項研究中確定了產(chǎn)生抗體的細胞發(fā)展背后的主要調(diào)節(jié)因子。這些發(fā)現(xiàn)提供了對免疫系統(tǒng)內(nèi)部運作的新見解,并可能有助于了解組織如何發(fā)育以及某些癌癥是如何發(fā)生的。
該研究于 9 月 23 日發(fā)表在《自然免疫學(xué)》上,將計算分析與先進的分子生物學(xué)和基因組技術(shù)相結(jié)合,確定了一種名為 Oct2 的蛋白質(zhì),它是 B 細胞體液免疫反應(yīng)的關(guān)鍵決定因素。
在感染期間或接種疫苗后,成熟的 B 細胞形成生發(fā)中心,這是一種彈出式培訓(xùn)設(shè)施。在那里,細胞發(fā)生突變并重新排列它們的抗體編碼基因,直到它們產(chǎn)生改進的抗體或嘗試死亡。這個過程是身體對許多病原體做出反應(yīng)的核心,但它也充滿了危險。位置不當(dāng)?shù)?B 細胞突變會導(dǎo)致淋巴癌。
“我們所有的細胞都有防止突變的防御機制,但 B 細胞實際上做相反的事情;它們專注于突變,而且速度非??欤?rdquo;共同資深作者、Gebroe 家族血液學(xué)教授 Ari Melnick 博士說/腫瘤學(xué)和威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院 Sandra 和 Edward Meyer 癌癥中心的成員。
先前的研究表明,B 細胞通過改變其基因組不同部分的可及性來控制其生發(fā)中心的成熟,并觸發(fā)基因表達變化的級聯(lián)反應(yīng)以指導(dǎo)和限制其發(fā)育。但是什么協(xié)調(diào)所有這些信號呢?
為了回答這個問題,威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院研究生 Ashley Doane 與威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院和洛克菲勒大學(xué)的同事首先采用了一種計算方法,繪制了成熟 B 細胞所經(jīng)歷的所有基因調(diào)控變化圖。
梅爾尼克博士說:“我們開始創(chuàng)建在這段時間內(nèi)出現(xiàn)和消失的所有監(jiān)管要素的地圖集。” 通過開發(fā)新的計算方法,該團隊能夠?qū)ψ兓M行去卷積,以將 OCT2 識別為似乎是該過程根源的分子。
但是,OCT2 在生發(fā)中心的分布與成熟 B 細胞激活前的分布驚人地相似。研究人員在實驗室中用新的基因組和分子工具探測 B 細胞,在未成熟的 B 細胞中發(fā)現(xiàn)了 OCT2,它預(yù)先定位在基因組位置,稍后它會在生發(fā)中心反應(yīng)期間發(fā)揮作用。另一種基因調(diào)控蛋白 OCA-B 觸發(fā)由 OCT2 標(biāo)記的基因組位置變得活躍,將它們變成“超級增強子”,驅(qū)動 B 細胞成熟調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的其余部分。
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