UNH 領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)對(duì)乳木果樹基因組進(jìn)行測(cè)序
新罕布什爾州達(dá)勒姆——乳木果樹是一種重要的社會(huì)和經(jīng)濟(jì)作物,以流行的乳木果油產(chǎn)品而聞名——一種價(jià)值數(shù)百萬(wàn)美元的成分,用于化妝品、個(gè)人護(hù)理產(chǎn)品、藥品和巧克力。對(duì)于生活在“乳木果帶”的數(shù)十萬(wàn)非洲家庭來(lái)說,它也是重要的營(yíng)養(yǎng)和收入來(lái)源。盡管需求不斷增加,但生長(zhǎng)緩慢的乳木果樹正受到其他經(jīng)濟(jì)作物的威脅,其保存很可能在于其遺傳改良。為了開展這項(xiàng)工作,由新罕布什爾大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)對(duì)乳木果樹的基因組進(jìn)行了測(cè)序,為該物種的戰(zhàn)略發(fā)展提供了寶貴的資源。
“一棵乳木果樹可能需要 25 年或更長(zhǎng)時(shí)間才能投入生產(chǎn),因此農(nóng)民等待那么長(zhǎng)時(shí)間并懷疑一棵樹是否值得保留的成本可能非常高,”特種作物改良副教授 Iago Hale 說。“由于生長(zhǎng)期如此之長(zhǎng),傳統(tǒng)的育種策略根本不可行,這也是沒有任何高性能乳木果品種的原因之一。乳木果基因組將使研究人員能夠在幼苗發(fā)芽后立即評(píng)估其潛力,并通過基因組啟用的樹木選擇,我們可以開始研究這個(gè)困難的物種。”
在他們的研究中,在植物科學(xué)期刊前沿網(wǎng)上公布,研究人員組裝的牛油果樹染色體規(guī)模的參考基因組。與人類基因組一樣,乳木果樹基因組包含決定性狀的基因,可幫助研究人員確定樹木特征。研究人員的基因組注釋導(dǎo)致識(shí)別出 38,505 個(gè)編碼基因。對(duì)各種樹木進(jìn)行的進(jìn)一步比較測(cè)序揭示了近 350 萬(wàn)種自然遺傳變異,稱為單核苷酸多態(tài)性 (SNP),可用于區(qū)分樹木并開始了解重要屬性背后的遺傳學(xué)。
乳木果油在生活在跨越 20 多個(gè)國(guó)家的蘇多-薩赫勒地區(qū)的數(shù)百萬(wàn)非洲家庭的日常生活中發(fā)揮著重要作用。收集乳木果幾乎是整個(gè)乳木果帶的普遍家庭活動(dòng),與其他經(jīng)濟(jì)活動(dòng)不同,幾乎完全由女性控制。根據(jù)每日乳木果油消費(fèi)數(shù)據(jù),參與乳木果采集的女性人數(shù)估計(jì)超過 1800 萬(wàn)。乳木果被稱為“女性的黃金”,因?yàn)槠洚a(chǎn)品的銷售使女性能夠在谷物收獲結(jié)束后為家人獲得額外的食物,并為家庭開支(包括衣服、醫(yī)藥和學(xué)費(fèi))創(chuàng)造現(xiàn)金。乳木果供應(yīng)的季節(jié)性也很重要,因?yàn)槿槟竟俏ㄒ豢梢詮V泛使用的水果,
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