通過將數(shù)據轉換為聲音,科學家們發(fā)現(xiàn)氫鍵如何促成閃電般的快速旋轉,將一串氨基酸轉化為功能性折疊蛋白質。
他們的報告發(fā)表在《美國國家科學院院刊》上,對蛋白質從展開狀態(tài)轉變?yōu)檎郫B狀態(tài)時發(fā)生的氫鍵事件序列提供了前所未有的觀點。
伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校化學教授 Martin Gruebele 表示:“蛋白質必須正確折疊才能成為酶或信號分子或任何其功能,即蛋白質在我們體內所做的所有事情。”作曲家兼軟件開發(fā)人員 Carla Scaletti。
錯誤折疊的蛋白質會導致阿爾茨海默病、帕金森病、囊性纖維化和其他疾病。為了更好地理解這個過程是如何出錯的,科學家必須首先確定一串氨基酸如何在細胞的水環(huán)境中轉變?yōu)樽罱K形式。實際的轉換發(fā)生得非???,“大約在 70 納秒到 2 微秒之間,”Gruebele 說。
氫鍵是相對較弱的吸引力,可排列位于蛋白質中不同氨基酸上的原子。折疊蛋白將在內部并與其周圍的水分子形成一系列氫鍵。在此過程中,蛋白質擺動成無數(shù)潛在的中間構象,有時會遇到死胡同并回溯,直到偶然發(fā)現(xiàn)另一條路徑。
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