多組學(xué)方法識(shí)別大量與酒精使用障礙相關(guān)的候選基因

西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院的研究人員使用多組學(xué)方法發(fā)表了成癮遺傳學(xué)領(lǐng)域的第一項(xiàng)此類研究，以提供與飲酒和酒精使用障礙(AUD)相關(guān)的大量因果候選基因列表.該研究還顯示了酗酒、阿爾茨海默病和其他神經(jīng)退行性疾病之間的潛在聯(lián)系。研究結(jié)果于 8 月 20 日發(fā)表在Nature Communications 上。

酒精使用障礙是復(fù)雜的、中等遺傳性的精神障礙，與發(fā)病率和死亡率升高有關(guān)。雖然之前的研究已經(jīng)確定了與飲酒相關(guān)的位點(diǎn)(遺傳區(qū)域)，但本研究旨在確定變異體和基因本身。“鑒定全基因組關(guān)聯(lián)研究 (GWAS) 位點(diǎn)背后的因果變異和基因?qū)τ诹私饩凭褂谜系K的生物學(xué)和改善其治療至關(guān)重要，”第一和共同通訊作者 Manav Kapoor 說(shuō)。博士，研究期間西奈山神經(jīng)科學(xué)、遺傳學(xué)和基因組學(xué)助理教授。

為了確定與澳元和每周飲酒量 (DPW) 相關(guān)的基因，這是一種用于評(píng)估酒精消耗的措施，研究團(tuán)隊(duì)整合了多組學(xué)數(shù)據(jù)，使用基于孟德?tīng)栯S機(jī)化的方法對(duì)來(lái)自腦組織和骨髓的最大可用轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行了整合細(xì)胞。使用來(lái)自這些組織的數(shù)據(jù)，該團(tuán)隊(duì)精細(xì)定位了復(fù)雜基因座并確定了可能的變異和候選基因，包括與酗酒相關(guān)的SPI1和MAPT基因。還發(fā)現(xiàn)SPI1和MAPT與其他精神和神經(jīng)退行性疾病的易感性有關(guān)，包括抑郁癥和阿爾茨海默病。

SPI1(Spi-1 Proto-Oncogene) 編碼 ETS 域轉(zhuǎn)錄因子 (PU.1)，可在髓樣和 B 淋巴樣細(xì)胞發(fā)育和體內(nèi)平衡過(guò)程中調(diào)節(jié)基因表達(dá)。鑒于SPI1控制了幾個(gè)下游基因的表達(dá)，正如在過(guò)去對(duì)人類和動(dòng)物大腦的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析中所觀察到的那樣，該基因可能是在飲酒行為中豐富免疫途徑的一個(gè)主要原因。

研究中分析的MAPT基因編碼 tau 蛋白，該蛋白以其在中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病中的作用而聞名，例如阿爾茨海默病、額顳葉癡呆、帕金森病和其他稱為 tauopathies 的神經(jīng)退行性疾病。

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